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  • 联系人:

    翌圣生物

  • 所在地区:

    上海

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    体外诊断、耗材、技术服务、抗体、ELISA 试剂盒、细胞库 / 细胞培养、试剂

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新品上新|植物rRNA去除试剂盒,看得见的去除效率!

967 人阅读发布时间:2022-02-11 13:13

 
最近,有小伙伴私信小翊,抱怨转录组建库,最后得到的有效信息和耗费的财力、物力、人力、时间相比,简直是九牛二毛。归根到底,竟是rRNA惹的祸。
 
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转录组(transcriptome)是指在某一特定生理条件下,细胞、组织或者生物体内所有转录产物的集合,即转录出来的所有RNA的总和,包括编码RNA(mRNA)和非编码RNA(tRNA、rRNA、miRNA、lncRNA、circRNA)等不同类型的RNA分子,其中,rRNA约占RNA总量的 80%以上,是最多的一类RNA。
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图1:总RNA中各种RNA占比饼状图
rRNA作为总RNA中最丰富的成员,提供的转录本信息却少之又少,且检测过多会掩盖其它基因的表达丰度,从而增加低丰度转录本的检测难度。因此,通常在测序之前从总RNA样品中去除rRNA,rRNA去除的效率也被视为最大化读取到转录物的关键因素。

新品简介
翊圣生物最-新推出植物rRNA去除试剂盒Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Plant)(#12254),满足客户rRNA去除的多元化需求,致力于将转录本信息读取做到最大化。
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图2:植物rRNA去除试剂盒
 
Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Plant)利用RNase H消化法去除植物来源总RNA中的核糖体RNA(包括细胞质18S、25S rRNA,线粒体18S、26S rRNA,叶绿体16S、23S rRNA)以保留信使RNA(mRNA)和其它非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成或其它下游应用。
 
产品特点
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图3:植物rRNA去除试剂盒特点

操作流程
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图4:植物rRNA去除操作流程

产品数据
1、不同起始量,rRNA的去除效率测试
不同Input量的拟南芥叶片RNA,使用12254进行rRNA去除后衔接12251构建链特异性文库,并进行 Illumina 双端测序(2 × 150 bp),分析下机数据中rRNA的占比。结果表明:测试的所有起始量均能有效去除rRNA。
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图5:不同投入量,rRNA去除效率图

2、重复实验相关性测试
1μg拟南芥叶片RNA,使用12254进行rRNA去除后衔接12251构建链特异性文库,实验进行3次重复。文库分别进行 Illumina 双端测序(2 × 150 bp),分析下机数据不同转录本的表达量。结果表明:3次重复转录本表达相关性保持一致。
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图6:植物rRNA去除试剂重复实验相关性测试图
  1. 不同投入量相关性测试
不同Input量的拟南芥叶片RNA,使用12254进行rRNA去除后衔接12251构建链特异性文库,并进行 Illumina 双端测序(2 × 150 bp),分析下机数据不同转录本的表达量。结果表明:测试的所有起始量转录本表达相关性保持一致。
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图7:植物rRNA去除试剂不同投入量相关性测试图
  1. 多个物种的rRNA去除效率测试
不同物种来源的1 μg Total RNA,使用12254进行rRNA去除后衔接12251构建链特异性文库,同时构建未去除的文库,并进行 Illumina 双端测序(2 × 150 bp),分析下机数据不同物种在去除前后rRNA的占比。结果表明:针对多种植物来源RNA,该试剂盒均能有效去除rRNA。
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图8:多物种rRNA去除效率测试图

好啦,产品介绍到这里就结束啦!性能如此优秀,是不是心动的感觉?心动不如行动,小伙伴们快来点击申请领取试用吧,数量有限(限领20),先到先得哦。也欢迎小伙伴们积极向小翊反馈使用效果,反馈有奖哦。
 

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